ABSTRACT

Colibacillosis is considered important in the poultry industry because it generates economic losses due to the disturbance of growth, the decline in production, an increase number of culled chicken, and reduced quality of carcasses and eggs. It is caused by the Avian Pathogenic E. coli (APEC). To overcome this, antibiotics have been widely used to eliminate E. coli infection in poultry farms in recent years. Treatment with antibiotics has been considered as a vital regimen to control E. coli infection at the farm level for many years. However, high frequency of antibiotic resistance of E. coli isolates from chicken has become the center of attention due to public health importance. The aim of the present study is to determine antimicrobial susceptibility among a collection of avian pathogenic E. coli strains isolated from chicken. Multidrug resistant profiles against 10 different antibiotics of 24 E. coli isolates were determined by using disk diffusion method according to Clinical Laboratory Standard Institute (CLSI). Antibiogram revealed that 81.6% of the E. coli isolates showed multidrug resistant profiles to different antibiotics. Most of the E.coli isolates were highly resistant to cefuroxime (91.7%), followed with amoxiciline (87.5%), imipenem and cefotaxime (79.1%), cefexime (58.3%), ceftriaxone and nalidixic acid (25%). Out of 24 isolates tested, 5.9% were resistant to six antibiotics. These findings also demonstrated that most of the isolates were susceptible to antibiotics commonly used for E.coli infections treatment in poultry with lowest resistant score against ofloxacin (12.5%) and gentamycin (12.5%). Moderate resistant profiles were observed towards nalidixic acid and ceftriaxone (25%). High percentage of multidrug resistance was found among the E. coli isolated from chicken as an indicator to more serious problems in animal health. Therefore, continuous surveillance of antibiotic resistance profiles in chicken and other food animals is crucial to ensure food chain safety.

TABLE OF CONTENTS

Title Page                                                                                                                                  i

Certification                                                                                                                              ii

Dedication                                                                                                                                iii

Acknowledgements                                                                                                                 iv

Table of Contents                                                                                                                    v

List of Tables                                                                                                                          vii

Abstract                                                                                                                                 viii

CHAPTER ONE: INTRODUCTION                                                                                                                                              1.1. Aims and Objectives                                                                                                               7

CHAPTER TWO: REVIEW OF RELATED LITERATURE                                        9                                   

2.1. Antimicrobials and Antimicrobial resistance                                                                      9    

2.2. Scope of antimicrobial resistance in Bacteria                                                                    10                                

2.3. Modes of action of Antimicrobial                                                                                        11

2.4. Mechanisms of antimicrobial resistance in bacteria                                                          12                        

2.5. Predisposing factors for development of antimicrobial resistance                                   12                                       

2.6.1 Phenotypic method                                                                                                              13 

2.7. Diffusion Technique                                                                                                            13                        

2.8 Growth and Inactivation                                                                                                       14

2.9 Usage of chicken as the study animal                                                                                   14                                                                                                        

CHAPTER THREE: MATERIALS AND METHODS

3.1. Sample Collection                                              16                                                      3.2. Isolation and identification                                                                                      16                

3.3. Antimicrobial susceptibility testing                                                              16                                                 

3.4. Data management and statistical analysis                                                        17                 

CHAPTER FOUR: RESULTS    18                                                                                                                                 

CHAPTERFIVE: DISCUSSION AND CONCLUSION                                                21          

Conclusion                                                                                  24                                     Recommendation                                                                                            25

References                                                                                                      26